MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187092	CCG	2	6	38	43	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187092	GTTG	2	8	56	63	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187092	AGC	2	6	150	155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249668
4	NT_187092	CTGG	2	8	208	215	0 %	25 %	50 %	25 %	409249668
5	NT_187092	A	7	7	250	256	100 %	0 %	0 %	0 %	409249668
6	NT_187092	GTT	2	6	430	435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249668
7	NT_187092	CTG	2	6	457	462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249668
8	NT_187092	GCG	2	6	506	511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249668
9	NT_187092	AGA	2	6	525	530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249668
10	NT_187092	CTGG	2	8	568	575	0 %	25 %	50 %	25 %	409249668
11	NT_187092	GC	3	6	700	705	0 %	0 %	50 %	50 %	409249668
12	NT_187092	CGC	2	6	887	892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NT_187092	T	6	6	900	905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187092	TGG	2	6	936	941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249669
15	NT_187092	CGGT	2	8	969	976	0 %	25 %	50 %	25 %	409249669
16	NT_187092	CAC	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249669
17	NT_187092	CGG	2	6	1027	1032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249669
18	NT_187092	AAACA	2	10	1040	1049	80 %	0 %	0 %	20 %	409249669
19	NT_187092	TTA	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249670
20	NT_187092	AAC	2	6	1195	1200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249670
21	NT_187092	T	7	7	1227	1233	0 %	100 %	0 %	0 %	409249670
22	NT_187092	A	7	7	1241	1247	100 %	0 %	0 %	0 %	409249670
23	NT_187092	CGCCA	2	10	1342	1351	20 %	0 %	20 %	60 %	409249670
24	NT_187092	GGA	2	6	1395	1400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249670
25	NT_187092	TCAG	2	8	1409	1416	25 %	25 %	25 %	25 %	409249670
26	NT_187092	TGCT	2	8	1604	1611	0 %	50 %	25 %	25 %	409249670
27	NT_187092	GTG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249670
28	NT_187092	TCG	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187092	TCG	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187092	CAAA	2	8	1704	1711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NT_187092	T	6	6	1765	1770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187092	T	6	6	1840	1845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187092	TGGG	2	8	1900	1907	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187092	T	6	6	1968	1973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187092	TGA	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187092	CTC	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NT_187092	AAG	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187092	GA	3	6	2128	2133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187092	AAG	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249671
40	NT_187092	TAC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249671
41	NT_187092	TAT	2	6	2234	2239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249671
42	NT_187092	CGG	2	6	2354	2359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187092	T	6	6	2362	2367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187092	CA	3	6	2393	2398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NT_187092	TCCGA	2	10	2417	2426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NT_187092	CTG	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187092	TGT	2	6	2503	2508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187092	T	6	6	2528	2533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187092	TGG	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249672
50	NT_187092	TG	3	6	2578	2583	0 %	50 %	50 %	0 %	409249672
51	NT_187092	TCT	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249672
52	NT_187092	TAC	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
53	NT_187092	CAT	2	6	2721	2726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
54	NT_187092	ATC	2	6	2752	2757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
55	NT_187092	ATC	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
56	NT_187092	TCA	2	6	2816	2821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
57	NT_187092	GTA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249672
58	NT_187092	GTT	2	6	2865	2870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249672
59	NT_187092	CAT	2	6	2874	2879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
60	NT_187092	TCA	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
61	NT_187092	TCA	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
62	NT_187092	ATC	3	9	2986	2994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
63	NT_187092	TCC	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249672
64	NT_187092	ATC	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
65	NT_187092	CAT	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
66	NT_187092	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	409249672
67	NT_187092	CAT	2	6	3187	3192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
68	NT_187092	ATT	2	6	3193	3198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249672
69	NT_187092	CTG	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249672
70	NT_187092	ATG	2	6	3227	3232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249672

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.